BM microbiologie moléculaire des fondamentaux au diagnostic syndromique

Objectifs

Approfondir les techniques avancées utilisées en Biologie Moléculaire. Le domaine exploré est la Microbiologie qui couvre l'ensemble des techniques développées lors de la formation.
Décrire la structure des acides nucléiques des micro-organismes en s'appuyant sur les notions acquises lors de la session de BM Bases et/ou acquises sur le terrain
Comprendre les principes des diverses techniques utilisées en microbiologie (PCR quantitative, séquençage Sanger et NGS, diagnostic syndromique et PCR multiplex) avec l'étude de cas concrets en complément de présentations théoriques
Définir et comprendre la métagénomique structurale et fonctionnelle avec des exemples applicatifs en milieu hospitalier.

Programme de la formation

Bases : Préparation d'acides nucléiques, PCR classique, PCR en temps réel, Séquençage sanger, Bases techniques du NGS

Virologie : Virologie générale, Apport de la PCR en temps réel, multiplex, syndromique et séquençage
Bactériologie : Bactériologie générale, Apport de la PCR en temps réel, Apport du séquençage haut débit pour le suivi de la diffusion de la résistance, Antibiogramme in silico
Parasitologie et Mycologie : Parasitologie et mycologie générale, la place de la BM, Validation et vérification de méthode, PCR en temps réel qualitative et quantitative, PCR Digitale, Lamp, Apport de Séquençage, microsatellites
Métagénomique Clinique, Résistance et génotypage en virologie, Epidémiologie moléculaire bactérienne et hygiène hospitalière, L'avenir du diagnostic en biologie moléculaire infectieuse
Discussion autour des artéfacts à tous les niveaux de la technique, étude de cas clinico-biologiques;
Méthodes pédagogiques mobilisées :
Exposés, travaux dirigés, étude de cas pratiques, questions/réponses, quizz au cours de la formation

Modalités d'évaluation :
Quizz en début et fin de formation
Questionnaires d'évaluation en fin de formation

Validation et sanction

Attestation de formation

Type de formation

Non certifiante

Sortie

Sans niveau spécifique