Master mention bio-informatique 1ère année

• Master mention bio-informatique - Code CertifInfo 116852
  • Niveau de qualification : 7 - Savoirs hautement spécialisés

Objectifs

Le parcours BIMS vise à former des ingénieurs bioinformaticiens et biostatisticiens ainsi que des futurs doctorants spécialistes de la gestion, du traitement et de l'analyse de données biologiques, notamment massives issues des approches expérimentales à très grande échelle (expérimentations qualifiées de Big Data) telles que : celles issues des nouvelles technologies de séquençage de l'ADN et de l'ARN (Next Generation Sequencing) ou des technologies analytiques par RMN et spectrométrie de masse haute résolution pour l'étude des protéines, des métabolites et des structures moléculaires. Les sciences omiques prises individuellement (génomique, métagénomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique) comme l'intégration de données multi-omiques (mais aussi cliniques, environnementales etc..) et la biologie des systèmes complexes sont concernées. Les diplômés sont formés aux sciences des données les plus pointues comme les méthodes d'apprentissage automatique et profond (« machine learning » et « deep learning » de l'intelligence artificielle). Ils sont également compétents en matière de techniques de visualisation et de représentation des données biologiques, des connaissances et de conception et développement de solution logicielle innovante.

Le programme de la formation est intégré et fortement coordonné. Il est à la fois disciplinaire fondamental (sciences omiques et biologie structurale, informatique, mathématiques), pluridisciplinaire (sciences bioinformatiques) et généraliste abordant les différents aspects du domaine aujourd'hui (bioinformatique moléculaire, fonctionnelle, structurale, intégrative).

Programme de la formation

Semestre 1 :


Programmation 1

• 50h (5 CE) Langages : Python - Technologies web 1

Modélisation Statistique et mathématiques

• 40h (4 CE) Modélisation statistique - Algèbre linéaire

Analyse bioinformatique en sciences omiques 1

• 45h (5 CE) Analyse de données NGS et annotation 1,

Analyse de données en protéomique 1

Génomique Transcriptomique

• 40 h (4 CE) Évolution des génomes et phylogénie

• 30h (3 CE) Variabilité génétique et santé

• 20h (3 CE) UE à choix

• 40h (3 CE) Métabolome Protéome Fluxome,

Ou Biologie structurale

Environnement professionnel 1

• 30h (3 CE) Anglais, Métiers de la bioinformatique


Semestre 2 :


Systèmes et réseaux informatiques

• 24 h (2 CE) Sciences des données 1

• 90 h (8 CE) Système de Gestion de Bases de Données 1,

Analyse de données et exploration avec R 1,

Analyse de données et calcul scientifique avec Python (Machine Learning)

Analyse bioinformatique en sciences omiques 2

• 24h (4 CE) Environnement professionnel 2

• 22 h (2 CE) Veille et communication scientifique,

Ingénierie logicielle 1 : bonnes pratiques de développement (pratiques FAIR)

Stage

• 4 mois ou plus (14 CE)

1re immersion sous convention de stage avec gratification en France ou à l'international avec possibilités de bourses de mobilité.

Validation et sanction

Master mention bio-informatique

Type de formation

Certifiante

Sortie

Bac + 5 et plus