Master mention bio-informatique - 2ème année

• Master mention bio-informatique - Code CertifInfo 116852
  • Niveau de qualification : 7 - Savoirs hautement spécialisés

Objectifs

Le parcours BIMS vise à former des ingénieurs bioinformaticiens et biostatisticiens ainsi que des futurs doctorants spécialistes de la gestion, du traitement et de l'analyse de données biologiques, notamment massives issues des approches expérimentales à très grande échelle (expérimentations qualifiées de Big Data) telles que : celles issues des nouvelles technologies de séquençage de l'ADN et de l'ARN (Next Generation Sequencing) ou des technologies analytiques par RMN et spectrométrie de masse haute résolution pour l'étude des protéines, des métabolites et des structures moléculaires. Les sciences omiques prises individuellement (génomique, métagénomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique) comme l'intégration de données multi-omiques (mais aussi cliniques, environnementales etc..) et la biologie des systèmes complexes sont concernées. Les diplômés sont formés aux sciences des données les plus pointues comme les méthodes d'apprentissage automatique et profond (« machine learning » et « deep learning » de l'intelligence artificielle). Ils sont également compétents en matière de techniques de visualisation et de représentation des données biologiques, des connaissances et de conception et développement de solution logicielle innovante.

Le programme de la formation est intégré et fortement coordonné. Il est à la fois disciplinaire fondamental (sciences omiques et biologie structurale, informatique, mathématiques), pluridisciplinaire (sciences bioinformatiques) et généraliste abordant les différents aspects du domaine aujourd'hui (bioinformatique moléculaire, fonctionnelle, structurale, intégrative).

Programme de la formation

S3 BIMS (alternance 1 an)


Programmation 2 Langage C et POO avec Python

• 40h (3 CE)

Algorithmique et structures de données

• 70h (4 CE)

Modèles de Markov et de Markov cachés

• 40h (3 CE)

Sciences des données 2

• 84h (6 CE)

SGBD 2 : noSQL et optimisation,

Analyse de données et exploration avec R - 2,

Apprentissage automatique avec Python (machine learning)

Analyse bioinformatique en sciences omiques 3

• 26h (3 CE)

Bioinformatique en génomique comparative

• 60h (4 CE)

Bioinformatique structurale et drug design

• 40h (3 CE)

Environnement professionnel 3

• 40h (2 CE)

Anglais,

Communication scientifique,

Ingénierie logicielle : génie managérial

Mission professionnelle en alternance 1

• Contrat de 17mois (2 CE)


S4 BIMS (alternance 6 mois)


Sciences des données 3

• 60h (6 CE)

Ontologie pour web sémantique,

Apprentissage profond avec Python

(deep learning)

Technologies web 2 :

échanges et sécurités des données

• 30h (3 CE)

Environnement professionnel 4

• 40h (3 CE)

Anglais,

Insertion : réussir son entretien

Systèmes dynamiques,

réseaux et intégration de données

• 70h (5 CE)

Modélisation et systèmes dynamiques en biologie,

Réseaux, interactions et intégration de données

Mission professionnelle en alternance 2

• Alternance 2

ou

• Alternance 2 et stage international

Validation et sanction

Master mention bio-informatique

Type de formation

Certifiante

Sortie

Bac + 5 et plus